Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC57Q2TAC2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC57Q2TAC2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms