Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL68

PROSER3, Proline and serine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROSER3Q2NL68 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROSER3Q2NL68 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROSER3Q2NL68 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROSER3Q2NL68 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROSER3Q2NL68 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROSER3Q2NL68 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROSER3Q2NL68 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROSER3Q2NL68 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROSER3Q2NL68 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROSER3Q2NL68 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PROSER3Q2NL68 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROSER3Q2NL68 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROSER3Q2NL68 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PROSER3Q2NL68 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PROSER3Q2NL68 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROSER3Q2NL68 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms