Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C17orf58Q2M2W7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
C17orf58Q2M2W7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms