Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ODF4Q2M2E3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms