Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
QSER1Q2KHR3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms