Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
COL24A1Q17RW2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL24A1Q17RW2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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