Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
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NDUFA9Q16795 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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NDUFA9Q16795 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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NDUFA9Q16795 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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NDUFA9Q16795 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFA9Q16795 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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