Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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EXT1Q16394 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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EXT1Q16394 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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EXT1Q16394 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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EXT1Q16394 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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EXT1Q16394 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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EXT1Q16394 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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EXT1Q16394 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EXT1Q16394 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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EXT1Q16394 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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EXT1Q16394 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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EXT1Q16394 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EXT1Q16394 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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