Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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NEDD8Q15843 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD8Q15843 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD8Q15843 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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