Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CHRNA6Q15825 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA6Q15825 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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