Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF4Q15306 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms