Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PTPRRQ15256 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PTPRRQ15256 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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PTPRRQ15256 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTPRRQ15256 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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