Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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HERPUD1Q15011 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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HERPUD1Q15011 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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HERPUD1Q15011 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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HERPUD1Q15011 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERPUD1Q15011 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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