Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMCO1Q147U7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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