Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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SEMA3AQ14563 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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SEMA3AQ14563 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SEMA3AQ14563 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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