Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDK13Q14004 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
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