Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ITGA9Q13797 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGA9Q13797 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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