Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTCH1Q13635 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTCH1Q13635 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
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