Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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CUL3Q13618 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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CUL3Q13618 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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