Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GPM6BQ13491 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPM6BQ13491 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms