Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
STRN3Q13033 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms