Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRDM2Q13029 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
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