Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB40BQ12829 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms