Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD3Q0VAK6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms