Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAD51Q06609 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms