Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms