Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KCNC4Q03721 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms