Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DSC2Q02487 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms