Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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FAM3AP98173 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3AP98173 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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