Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKP1P63208 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKP1P63208 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP1P63208 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP1P63208 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP1P63208 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP1P63208 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP1P63208 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP1P63208 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP1P63208 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP1P63208 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP1P63208 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP1P63208 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SKP1P63208 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SKP1P63208 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms