Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
ROMO1P60602 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms