Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSDMDP57764 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms