Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CLDN12P56749 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLDN12P56749 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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