Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BRCA2P51587 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms