Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBP2P50120 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBP2P50120 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBP2P50120 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBP2P50120 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBP2P50120 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBP2P50120 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBP2P50120 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBP2P50120 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBP2P50120 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBP2P50120 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBP2P50120 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBP2P50120 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBP2P50120 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RBP2P50120 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RBP2P50120 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBP2P50120 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBP2P50120 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBP2P50120 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RBP2P50120 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBP2P50120 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBP2P50120 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBP2P50120 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBP2P50120 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBP2P50120 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBP2P50120 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBP2P50120 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RBP2P50120 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RBP2P50120 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RBP2P50120 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RBP2P50120 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBP2P50120 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBP2P50120 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBP2P50120 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBP2P50120 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBP2P50120 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RBP2P50120 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms