Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTHFSP49914 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTHFSP49914 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms