Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMPOP42166 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPOP42166 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPOP42166 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPOP42166 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPOP42166 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPOP42166 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPOP42166 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPOP42166 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPOP42166 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPOP42166 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPOP42166 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPOP42166 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPOP42166 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPOP42166 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPOP42166 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMPOP42166 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMPOP42166 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMPOP42166 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMPOP42166 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMPOP42166 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMPOP42166 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMPOP42166 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMPOP42166 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms