Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD40LGP29965 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms