Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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COL4A5P29400 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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COL4A5P29400 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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COL4A5P29400 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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COL4A5P29400 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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COL4A5P29400 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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COL4A5P29400 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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COL4A5P29400 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL4A5P29400 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL4A5P29400 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL4A5P29400 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL4A5P29400 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL4A5P29400 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL4A5P29400 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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