Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PEX2P28328 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PEX2P28328 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PEX2P28328 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PEX2P28328 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms