Protein–RNA interactions for Protein: P27708

CAD, CAD protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADP27708 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CADP27708 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CADP27708 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CADP27708 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CADP27708 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CADP27708 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CADP27708 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CADP27708 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CADP27708 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CADP27708 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CADP27708 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CADP27708 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CADP27708 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CADP27708 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms