Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERBB3P21860 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ERBB3P21860 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms