Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BCL3P20749 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BCL3P20749 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms