Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP4AP20648 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms