Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTRB1P17538 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms