Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC5A1P13866 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms