Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACTN1P12814 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms