Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM225BP0DP42 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.8 ms