Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C4AP0C0L4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C4AP0C0L4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms