Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP10P09238 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP10P09238 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP10P09238 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP10P09238 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP10P09238 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMP10P09238 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMP10P09238 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMP10P09238 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP10P09238 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP10P09238 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP10P09238 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP10P09238 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP10P09238 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP10P09238 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP10P09238 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP10P09238 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP10P09238 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP10P09238 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP10P09238 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMP10P09238 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms